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所谓非直属附属关系，大学通过协商，本着互惠互利，优势互补，共同发展的原则，选择一些医疗水平较高，具有临床教学能力的医院，在领导体制不变，隶属关系不变，经费渠道不变的情况下，建立非直属附属医院，大学根据协议规定对相关附属医院的某些方面进行管理。
但是，不管是直属，还是非直属附属关系，大学对附属医院都有四种管理模式，分别是战略管理型，科教管理型，技术指导型，以及全面管理型。
战略管理型，大学设立专门的医院管理机构，在分管副校长的领导下，全面负责医院的宏观管理，不介入附属医院的具体医疗业务管理。
科教管理型，附属医院医疗业务归地方卫生行政部门管理，大学主要管理附属医院的教育资源统筹和科研协作等，这种模式主要适用于非直属附属医院的管理。
技术指导型，附属医院作为大学临床教学医院对外使用大学的品牌资源，并接受大学医学生的临床实习任务。大学根据协议定期对医院进行技术指导和业务帮带，双方根据教学任务的多少，技术帮带的强度以及品牌资源的使用情况等因素相互支付管理，实习等相关费用。
全面管理型，大学各业务部门对附属医院进行对口管理，附属医院的人事任免，重大财务开支等事务均属大学管理，此模式有利于发挥附属医院的整体资源优势。
南江医学院对南江市医院，正是这种全面管理型模式。
