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杨洪森否认“黑账户”的存在。
对于国会调查“黑账户”杨洪森极为惹火，孙中山的倾向于建立专门的资金管理委员会，可杨洪森不想让人知道“黑账户”的存在，有些资金的使用是不能公开的。
杨洪森感觉孙中山是在与他争夺“黑账户”内资金的使用权。孙中山的确有这个意思，他目的是为了限制杨洪森对财政大权利的长期把持。最后，杨洪森做出了让步，不过五人资金管理委员会被扩充到了七人。国会对“黑账户”进行了不公开审查。因为涉及到了国家机密，调查报告中的大部分内容就删除，而该份报告也并没有对外公布。
在公开场合孙中山与杨洪森的关系依然融洽，但是他们在很多问题上都产生了巨大的分歧。
两个人走向分裂只是时间的问题。在党内思想上的分裂导致了两大阵营的形成，这种意识形态上的差距在孙、杨关系融洽时间被隐藏了起来，便当他们关系出现的裂痕，所有的人都能察觉到他们之间的微妙变化。国内反对派对杨洪森攻击一波胜过一波，其攻击的重点还是经济问题。杨洪森的强硬路线在党内遭到了批评，孙中山便是最大的反对者。这一些都迫使杨洪森在1923年退出内阁，他以身心疲惫为由向孙中山提出辞职，并推荐党内元老林森担任总理一职。日本人发现杨洪森辞职，将是一个很好的契机，所以他们向主动向国府靠拢。对他们而言和平的障碍消灭了。
杨洪森的辞职引起了全国不小的哄动，提交辞职的当天，杨洪森就随夫人宋美龄南下，在安庆停留了二个星期，主要会见当地的乡绅和百姓，此后，乘船前往庐山休养。
