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在与野兽漫长的抗争中，人族的武力逐渐强大，神宫人在城市周边建起了巨大的围墙，同时各地的军团不断驱逐野兽，最终把所有的野兽都被消灭，或者被赶到了大山深处和海洋深处，就这样，人族发展成为了神宫最强大的种族，并且在初生者的引领下，开始探索世界屏障和所有不适宜人族居住的地方，这应该是所有文明发展到一定程度后所必须的行为。
最终人族没有找到突破屏障进入虚空的方法，反而找到了与人间和地府相连的通道，初生者对通道非常重视，他们派遣探险队驾驶大型飞舟穿越通道，希望探索通道后面未知的世界。
这个过程中，古他们很高兴地发现了地府和人间都有和他们一样的初生者，他们之间可以互相交流，但在他们产生矛盾时却不能伤害对方，好像是一种深入骨髓的本能，法则不允许他们互相争斗，但可惜的是除了初生者之外，这两个位面再也没有智慧生物了。
在初生者们正在交流情报，并打算合作开发三个位面时，支配者入侵，毁灭之战开始，就是这样，拥有灿烂文明的神宫人族就这样失落了，但并没有完全灭绝，地府的不死者中有记忆的保留了一部分。
还有神宫中坚固的堡垒，当初设计师为了与支配者进行持久战争，将堡垒打造的坚固无比，并且将神宫文明的历史，核心技术都保存在每个堡垒的中心，把希望寄托在幸存的堡垒中，设计师计划就算剩下一个堡垒，也可以重现文明的辉煌，这些堡垒逐渐被岁月侵蚀成了“遗迹”，不只神宫人，它们给第二季的所有生命产生了巨大的影响。
由于毁灭之战的影响，神宫的世界屏障和法则都遭到了巨大的破坏，所以在神宫位面的自我修复的同时，第二季的生物也慢慢的繁衍，与上一季不同的是，因为灵气缺失和法则的不完整，这一季的神宫生物繁衍的异常缓慢，植物与动物种类变得更加多种多样，而初生者的茧的孵化周期也变长了。
历经漫长的进化，不止新的神宫人族拥有了智慧，狐族，灵族，翼族也几乎在同一时代拥有了智慧，从这时开始，到初生者诞生前的时候，这段历史对于各个智慧种族来说是一段黑暗的时代。
因为灵气不像上一季那么充沛，所有种族掌握的新符文威力大减，完全不能和上一季开始时媲美，每个种族都生存在艰苦的环境中，每天与数量庞大的野兽争夺有限的资源，时不时与其他的种族开战，其实种族间的仇恨并没有那么大，但在争夺资源这种残酷的战争中，一旦开战就不可能停止。
最终神宫人族依旧凭借数量占据了优势，并且与更聪慧的灵族合并，宣布了他们在神宫中的统治地位，狐族为了保全族人，全族撤回更深的山谷中，几乎不与外界交流了，翼族自大好战，依旧与野兽和人族抗衡，但就在这一时期，以夏阳为首的初生者诞生，标志着黑暗时代的终结。
夏阳是个如果生在人族必定会被称为天才，或者说天之骄子，他的天赋即使在初生者中也是独一无二的，三位面的初生者在诞生时一般都会倾听万物，或者简单的运用法则，夏阳和他们不一样，他可以完全理解每种事物的构成，或运行原理，只不过根据复杂程度的不同，所花费的时间不同罢了。
